Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp3Q7TNH6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms