Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNT7Q6ZNI0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNT7Q6ZNI0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms