Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx6Q6P8X1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx6Q6P8X1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms