Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms