Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tvp23aQ6NVH0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23aQ6NVH0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms