Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WSCD1Q658N2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD1Q658N2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms