Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vat1Q62465 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vat1Q62465 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms