Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga7Q61738 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms