Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CttnQ60598 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CttnQ60598 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CttnQ60598 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms