Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc5a6Q5U4D8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc5a6Q5U4D8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms