Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CDCA8Q53HL2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms