Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrfip1Q3UZ39 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms