Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms