Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc34Q3UI66 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc34Q3UI66 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms