Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms