Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Hace1Q3U0D9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hace1Q3U0D9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms