Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms