Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 RPS11BYBR048W 471 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 HPA2YPR193C 471 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YBR096WYBR096W 693 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 PSY4YBL046W 1326 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 FRE2YKL220C 2136 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 NFT1YKR103W 3657 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YGR237CYGR237C 2358 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 MLH1YMR167W 2310 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 AEP2YMR282C 1743 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 CTK1YKL139W 1587 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 UTP15YMR093W 1542 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 DBP5YOR046C 1449 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 TGL2YDR058C 981 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 GRX3YDR098C 858 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YDR209CYDR209C 414 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 BUR6YER159C 429 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 GCD14YJL125C 1152 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 AIM25YJR100C 984 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 GMH1YKR030W 822 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 RPL15AYLR029C 615 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 COQ9YLR201C 783 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 CYC2YOR037W 1101 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YPR203WYPR203W 309 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 PMS1YNL082W 2622 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 RPO41YFL036W 4056 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 TCB2YNL087W 3537 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 DUN1YDL101C 1542 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 TEC1YBR083W 1461 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 PDR1YGL013C 3207 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 VMA8YEL051W 771 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 RPL1BYGL135W 654 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 MRPL49YJL096W 486 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 RPL23AYBL087C 414 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 TUM1YOR251C 915 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 COA2YPL189C-A 207 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 RPL1AYPL220W 654 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 NDC80YIL144W 2076 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YER138CYER138C 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YER160CYER160C 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YJR027WYJR027W 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YML039WYML039W 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YML045WYML045W 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YMR050CYMR050C 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG41Q12048 MDV1YJL112W 2145 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 VBA4YDR119W 2307 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 SDP1YIL113W 630 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YIR014WYIR014W 729 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YLR012CYLR012C 300 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YOR055WYOR055W 435 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 CHS3YBR023C 3498 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 KRE2YDR483W 1329 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YHR078WYHR078W 1659 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 TAM41YGR046W 1158 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 SOL3YHR163W 750 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 SFH5YJL145W 885 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YKL066WYKL066W 444 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YKR075CYKR075C 924 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YLR416CYLR416C 399 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 HUB1YNR032C-A 222 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YBR209WYBR209W 318 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 JSN1YJR091C 3276 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 CTF18YMR078C 2226 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YAT2YER024W 2772 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 IME1YJR094C 1083 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 BET3YKR068C 582 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 MTD1YKR080W 963 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YMR147WYMR147W 672 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 SSN8YNL025C 972 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 KTI11YBL071W-A 249 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 HHF1YBR009C 312 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 HSH49YOR319W 642 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YMR1YJR110W 2067 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 CLG1YGL215W 1359 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 SAD1YFR005C 1347 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YJL132WYJL132W 2253 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 SVL3YPL032C 2478 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 TFC1YBR123C 1950 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YOS1YER074W-A 258 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 AML1YGR001C 747 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 RPL19BYBL027W 570 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 SAS2YMR127C 1017 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 YHL012WYHL012W 1482 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 MSA1YOR066W 1890 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG41Q12048 HER2YMR293C 1395 nt2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.2 ms