Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cass4Q08EC4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cass4Q08EC4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms