Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnma1Q08460 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnma1Q08460 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms