Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms