Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms