Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms