Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms