Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf1P84078 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf1P84078 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf1P84078 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf1P84078 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arf1P84078 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf1P84078 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms