Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1bP70700 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1bP70700 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms