Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms