Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps28P62858 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps28P62858 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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