Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab1AP62821 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab1AP62821 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms