Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtnsP57757 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtnsP57757 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtnsP57757 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtnsP57757 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CtnsP57757 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtnsP57757 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtnsP57757 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtnsP57757 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CtnsP57757 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtnsP57757 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtnsP57757 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtnsP57757 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms