Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckbrP56481 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CckbrP56481 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CckbrP56481 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CckbrP56481 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckbrP56481 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms