Protein–RNA interactions for Protein: P35979

Rpl12, 60S ribosomal protein L12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl12P35979 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl12P35979 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms