Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lef1P27782 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms