Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VimP20152 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VimP20152 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VimP20152 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VimP20152 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VimP20152 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VimP20152 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VimP20152 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VimP20152 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VimP20152 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VimP20152 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VimP20152 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VimP20152 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VimP20152 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VimP20152 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VimP20152 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VimP20152 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VimP20152 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VimP20152 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VimP20152 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VimP20152 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VimP20152 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VimP20152 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VimP20152 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VimP20152 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VimP20152 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VimP20152 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VimP20152 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VimP20152 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VimP20152 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VimP20152 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VimP20152 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VimP20152 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VimP20152 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VimP20152 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VimP20152 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VimP20152 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VimP20152 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VimP20152 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VimP20152 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VimP20152 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VimP20152 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VimP20152 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VimP20152 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VimP20152 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VimP20152 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VimP20152 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VimP20152 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VimP20152 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VimP20152 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VimP20152 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VimP20152 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VimP20152 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VimP20152 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VimP20152 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VimP20152 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VimP20152 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VimP20152 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VimP20152 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VimP20152 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VimP20152 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VimP20152 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VimP20152 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms