Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou4f1P17208 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms