Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgfb3P17125 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms