Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtaP09225 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtaP09225 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtaP09225 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LtaP09225 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtaP09225 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtaP09225 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtaP09225 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtaP09225 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LtaP09225 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtaP09225 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtaP09225 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtaP09225 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtaP09225 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtaP09225 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtaP09225 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtaP09225 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LtaP09225 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LtaP09225 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtaP09225 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtaP09225 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtaP09225 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtaP09225 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtaP09225 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtaP09225 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LtaP09225 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtaP09225 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtaP09225 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtaP09225 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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