Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp9O88851 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbbp9O88851 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms