Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd2O35927 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms