Protein–RNA interactions for Protein: L7N229

Gm4778, Predicted gene 4778, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4778L7N229 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm4778L7N229 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4778L7N229 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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