Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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