Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms