Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rarres1F6ZIS7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rarres1F6ZIS7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms