Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5218F6YH22 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5218F6YH22 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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