Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3095E9Q058 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms