Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptrhd1D3Z4S3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptrhd1D3Z4S3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms