Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms