Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cped1B2RX70 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms