Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf3B2RUQ2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms