Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms